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中國科研人員構(gòu)建油菜基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫

發(fā)布:2020/8/3 來源:新華網(wǎng) 作者: 瀏覽:3033

本文轉(zhuǎn)自【新華網(wǎng)】;

新華社武漢8月2日電(記者侯文坤)記者日前從中國農(nóng)業(yè)科學院油料作物研究所獲悉,該所油料作物基因組學與抗病性改良創(chuàng)新團隊成功破譯了油菜基因組的全轉(zhuǎn)錄信息密碼,構(gòu)建了油菜10萬余個基因的轉(zhuǎn)錄全景圖,使得油菜功能基因研究第一次有了相對標準的可參考的基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫,為相關研究提供了有力支撐。該項研究成果日前在線發(fā)表在國際知名期刊《The Plant Journal》上。


據(jù)參與該項研究的相關科研人員介紹,油菜基因組包含約12億個堿基和10萬余個基因,如何解讀這些海量的基因組信息成為功能基因研究的重要任務。根據(jù)分子生物學的中心法則,基因通過轉(zhuǎn)錄形成mRNA(信使核糖核酸)再翻譯成蛋白質(zhì)。由于基因的轉(zhuǎn)錄通常存在多種可變的剪切方式,一個基因可以形成許多種不同的mRNA。此前,由于技術和資源的限制,油菜一直缺乏全基因組水平所有基因的轉(zhuǎn)錄mRNA數(shù)據(jù)庫,導致油菜功能基因研究缺乏可查詢和可參考的基因注釋信息。


為了突破這一瓶頸,中國農(nóng)業(yè)科學院油料作物研究所油料作物基因組學與抗病性改良創(chuàng)新團隊采用最新的三代測序技術準確測定了油菜全長轉(zhuǎn)錄組,并自主開發(fā)了一套用于多倍體油菜復雜基因組的分型方法,成功繪制了油菜基因組的轉(zhuǎn)錄全景圖,構(gòu)建了油菜基因轉(zhuǎn)錄數(shù)據(jù)庫。該研究成果更新了人們對油菜基因和基因組的認識和理解,將為甘藍型油菜功能基因和遺傳改良研究,及基因組設計育種提供數(shù)據(jù)基礎和理論指導。




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